آشتیانی، سید جلال‌الدین (1378). منتخباتی از آثار حکمای الهی ایران، جلد 1-4، قم: تبلیغات اسلامی حوزه علمیه.
آصف، محمدهاشم (رستم الحکما)(1380). رستم التواریخ، باهتمام عزیزالله علیزاده، تهران: فردوسی.
اردبیلی، عبدالکریم محمد (1375). صفوة الآثار من اخبار، به کوشش میرهاشم محدث، چاپ شده در میراث اسلامی ایران، دفتر سوم، به کوشش رسول جعفریان، قم: کتابخانه آیت‌الله مرعشی نجفی، چاپ اول.
افندی، عبدالله (1401ق). ریاض العلماء و حیاض الفضلاء، ج2 ، قم: کتابخانه آیت الله مرعشی،چاپ اول.
امام جمعه، سید مهدی (1380). «مکتب فلسفی اصفهان و چالش‌های عصر صفوی»، مجموعه مقالات همایش اصفهان و صفویه، ج1، به اهتمام دکتر مرتضی دهقان‌نژاد، اصفهان: انتشارات دانشگاه اصفهان.
بیدآبادی، ملامحمد (1376). حسن دل در سیر و سلوک الی الله، تحقیق و تصحیح علی صدرایی خویی و محمدجواد نورمحمدی، قم: نهاوندی، چاپ اول.
تنکابنی، محمد بن سلیمان (1383). قصص العلماء، به کوشش محمد رضا برزگر خالقی و عفت کرباسی، تهران: علمی و فرهنگی.
حزین، شیخ محمدعلی (1375). تاریخ و سفرنامه حزین، تحقیق علی دوانی، تهران: انقلاب اسلامی.
خاتون‌آبادی، سید عبدالحسین (1352). وقایع السنین والاعوام، تصحیح محمدباقر بهبودی، تهران: کتابفروشی اسلامیه.
خراسانی، شرف‌الدین (1373). «اثولوجیا»، دایرةالمعارف بزرگ اسلامی، ج 6، زیر نظر کاظم موسوی بجنوردی، تهران: مرکز دایرةالمعارف بزرگ اسلامی، چاپ اول.
خواجویی، ملااسماعیل (1411ق). رسایل فقهی، ج2، تصحیح سید مهدی رجایی، قم: دارالکتاب الاسلامی.
دینانی،غلامحسین (1377). ماجرای فکر فلسفی در جهان اسلام، ج 2 و 3، تهران: طرح نو، چاپ اول.
رفیعی مهرآبادی،ابوالقاسم(1342). آتشکده اردستان ، ج2، تهران: چاپ اتحاد.
زنوزی، میرزا محمدحسن (1378). ریاض‌الجنة، ج3، تحقیق سیدمحمود مرعشی، قم: کتابخانه آیت‌الله مرعشی، چاپ اول.
سپنتا، عبدالحسین (1346). تاریخچه اوقاف اصفهان، اصفهان: انتشارات اداره کل اوقاف اصفهان.
صدرایی خویی، علی (1379). آشنای حق (شرح احوال و افکار آقا محمد بیدآبادی)، قم: نهاوندی، چاپ اول.
صدوقی، منوچهر (1359). تاریخ حکماء و عرفای متأخرین صدرالمتألهین، تهران: انجمن اسلامی حکمت و فلسفه ایران، چاپ اول.
ــــــــــــــــ (1381). تحریر ثانی (تاریخ حکما و عرفانی متأخر)، تهران: حکمت، چاپ اول.
صفت گل، منصور (1386). ساختار نهاد و اندیشه دینی در ایران عصر صفوی (تاریخ تحوّلات دینی ایران در سده‌های دهم تا دوازدهم هجری قمری)، تهران: خدمات فرهنگی رسا.
قاسمی، رحیم (1388). بزم معرفت (مشاهیر تکیه فاضل هندی)، اصفهان: کانون پژوهش، چاپ اول.
ــــــــــــــــ (1388). گلزار فضیلت (مشاهیر تکیه علامه خواجویی)، اصفهان: کانون پژوهش، چاپ اول.
کرباسی‌زاده اصفهانی، علی (1381). حکیم متأله بیدآبادی احیاگر حکمت شیعی در قرن دوازدهم هجری، تهران: پژوهشگاه علوم انسانی و مطالعات فرهنگی.
ــــــــــــــــ (1382). «حکیم خواجوی احیاءگر حوزه اصفهان در دوران فترت»، اصفهان: مجله حوزه، شماره یازدهم.
ــــــــــــــ (1383). «مکتب فلسفی اصفهان»، مجموعه مقالات دومین همایش حکیم ملاصدرا، تهران: بنیاد حکمت اسلامی صدرا، چاپ اول.
ــــــــــــــــ (1382). فاضل سراب و رویارویی مدرسه ملارجبعلی تبریزی با مدرسه ملاصدرا، مجموعه مقالات همایش فاضل سراب و اصفهان عصر وی، اصفهان: مجموعه فرهنگی، مذهبی تخت فولاد، چاپ اول.
کربن، هانری (1369). فلسفه ایرانی و فلسفه تطبیقی، ترجمه جواد طباطبائی، تهران: توس.
ــــــــــــــــ (1371). تاریخ فلسفه اسلامی، ترجمه سید جواد طباطبائی، ج 2، تهران: کویر.
مدرس هاشمی، میرسید حسن (1377). شرح رساله سیر و سلوک منسوب به آقا محمد بیدآبادی، با مقدمه و تصحیح و تعلیقات علی کرباسی‌زاده، قم: کانون پژوهش، چاپ اول.
مطهری، مرتضی (1373). خدمات متقابل اسلام و ایران، قم: انتشارات صدرا، چاپ بیستم.
مکارم، هادی (1378). «خرده‌گیران بر حکمت متعالیه»، مجله حوزه، ش 93، قم: دفتر تبلیغات اسلامی.
)